吉林省自然人税收管理系统扣缴客户端是一款专业的税务管理软件，它是由吉林省税务厅推出的，它满足吉林地区税务业务管理需求，是国家税务总局为了满足广大扣缴义务人的报税需求上线的软件，是专门用于个人所得税代扣代缴的客户端软件。
功能介绍
《扣缴客户端》主要用于扣缴义务人为在职员工申报个人所得说。对应的申报表是《个人所得税基础信息表(A表)》和《扣缴个人所得税报告表》。
为了降低报表填写难度，《扣缴客户端》对报表填写做了拆分处理。申报的主体流程是：
人员信息采集：人员信息采集的信息对应《个人所得税基础信息表(A表)》，系统采用先报送登记人员，再填写报表的方式。
报表填写：报表填写包括《扣缴个人所得税报告表》、《限售股转让所得扣缴个人所得税报告表》、《特定行业个人所得税年度申报表》三张报表。
主要常用的还是《扣缴个人所得税报告表》，其包含工资薪金所得、劳务报酬所得、稿酬所得等税法规定的相关所得。为了填写方便，每个所得单独填写，统一申报。
申报表报送：把填写完整的《扣缴个人所得税报告表》、《限售股转让所得扣缴个人所得税报告表》、《特定行业个人所得税年度申报表》申报到税局。普通单位一般只需要申报《扣缴个人所得税报告表》即可
网上缴款：申报完成后，需根据所申报税款，通过【网上缴款】功能缴纳税款。
安装说明
1.“自然人税收管理系统扣缴客户端”(即原来的金税三期个人所得税扣缴系统)是专门用于个人所得税代扣代缴申报的客户端软件。其中“自然人税收管理系统扣缴客户端完整安装包”适用于没有安装过本系统的电脑安装。“自然人税收管理系统扣缴客户端手工升级包”适用于安装了自然人税收管理系统扣缴客户端并且版本低于上述版本又无法自动完成在线升级的电脑进行升级安装。建议使用迅雷等下载工具下载。
2.“自然人税收管理系统扣缴客户端”建议安装在除C盘以外的硬盘，安装完后可以选择是否设置初次登录密码。
3.“自然人税收管理系统扣缴客户端”初次使用的设置为：纳税人识别号为统一社会信用代码，扣缴义务人名称为单位名称。如果统一社会信用代码证号或扣缴义务人名称不符，请联系主管税务机关获取。
4.“自然人税收管理系统扣缴客户端”中，单位员工离职的，在软件的“人员信息采集”中设置纳税人状态为“非正常”，并且填写离职日期。
5.扣缴义务人第一次申报，无默认的初始密码，需要自行设置申报密码。如果更换电脑或重新安装系统，申报密码为上次成功申报的密码。忘记申报密码的请到办税服务厅(金三税收管理系统-个人税收管理-申报-代扣代缴申报-个税代扣代缴申报密码发放)进行重置。
6.“自然人税收管理系统扣缴客户端”具有扣缴税款功能。扣缴税款前需签约财税库银横向联网系统，如果没有签约，使用“自然人税收管理系统扣缴客户端”申报后，可到办税大厅现金缴款。没有税款的，无需缴款。
7.“自然人税收管理系统扣缴客户端”有扣缴个人所得税报告表查询及打印功能。
8.扣缴义务人因更换电脑需重新安装系统的，请在“自然人税收管理系统扣缴客户端”的“系统设置”备份个税代扣代缴数据，之后将备份文件复制到新电脑恢复。
9.“自然人税收管理系统扣缴客户端”支持一台电脑申报多个企业或单位的个人所得税，通过软件右上角“企业管理”菜单添加多个企业或多个扣缴单位切换申报。
10.扣缴义务人在软件操作中遇到问题需要在线咨询的，可下载安装“个税服务中心完整安装包”免费使用。人工服务时间：征期内8:30-18:00，周末有人值班;非征期8:30-17:30，周末不值班。除此时间段外，由机器人自动应答。
11.扣缴义务人有个性化需求的，可以按照税务机关公布的扣缴客户端业务标准、接口标准自行开发实现，经具备国家资质的第三方检测机构检测通过后使用，并按征管法的规定向税务机关报备。
业务含义
扣缴客户端，用于扣缴义务人为个人代扣代缴个人所得税。按照相关法律规定，为个人代扣代缴税款时需要明细申报，即申报的税款必须具体到每个人。
因此，在进行个税申报前，需要把人员信息添加到软件中，再进行人员信息报送局端。需要添加的人员主要是本单位的在职员工。需要申报的个税通常是工资薪金、年终奖等。当然也包括劳务报酬、稿酬所得等其他个税扣缴。